Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMF1Q96S06 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMF1Q96S06 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMF1Q96S06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMF1Q96S06 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMF1Q96S06 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms