Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PANX1Q96RD7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PANX1Q96RD7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PANX1Q96RD7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PANX1Q96RD7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PANX1Q96RD7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PANX1Q96RD7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms