Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
INPP4AQ96PE3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
INPP4AQ96PE3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INPP4AQ96PE3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INPP4AQ96PE3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
INPP4AQ96PE3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
INPP4AQ96PE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INPP4AQ96PE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
INPP4AQ96PE3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
INPP4AQ96PE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
INPP4AQ96PE3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
INPP4AQ96PE3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
INPP4AQ96PE3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
INPP4AQ96PE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
INPP4AQ96PE3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INPP4AQ96PE3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INPP4AQ96PE3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms