Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RDH12Q96NR8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RDH12Q96NR8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RDH12Q96NR8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RDH12Q96NR8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RDH12Q96NR8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms