Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SFXN2Q96NB2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SFXN2Q96NB2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFXN2Q96NB2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFXN2Q96NB2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFXN2Q96NB2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFXN2Q96NB2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms