Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF578Q96N58 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF578Q96N58 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF578Q96N58 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF578Q96N58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF578Q96N58 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF578Q96N58 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF578Q96N58 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF578Q96N58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF578Q96N58 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF578Q96N58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF578Q96N58 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF578Q96N58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF578Q96N58 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF578Q96N58 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms