Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF145Q96MT1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF145Q96MT1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF145Q96MT1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF145Q96MT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF145Q96MT1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF145Q96MT1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF145Q96MT1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms