Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CFAP57Q96MR6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP57Q96MR6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP57Q96MR6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP57Q96MR6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP57Q96MR6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP57Q96MR6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms