Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JSRP1Q96MG2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JSRP1Q96MG2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JSRP1Q96MG2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
JSRP1Q96MG2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
JSRP1Q96MG2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms