Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGCZQ96LD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGCZQ96LD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SGCZQ96LD1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGCZQ96LD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGCZQ96LD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms