Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
KCNH8Q96L42 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
KCNH8Q96L42 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
KCNH8Q96L42 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
KCNH8Q96L42 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
KCNH8Q96L42 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
KCNH8Q96L42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
KCNH8Q96L42 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
KCNH8Q96L42 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
KCNH8Q96L42 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
KCNH8Q96L42 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
KCNH8Q96L42 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
KCNH8Q96L42 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
KCNH8Q96L42 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
KCNH8Q96L42 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
KCNH8Q96L42 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
KCNH8Q96L42 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.23
KCNH8Q96L42 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
KCNH8Q96L42 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
KCNH8Q96L42 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
KCNH8Q96L42 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
KCNH8Q96L42 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
KCNH8Q96L42 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
KCNH8Q96L42 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
KCNH8Q96L42 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
KCNH8Q96L42 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.21
KCNH8Q96L42 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
KCNH8Q96L42 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
KCNH8Q96L42 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
KCNH8Q96L42 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
KCNH8Q96L42 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
KCNH8Q96L42 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
KCNH8Q96L42 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
KCNH8Q96L42 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
KCNH8Q96L42 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
KCNH8Q96L42 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
KCNH8Q96L42 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
KCNH8Q96L42 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
KCNH8Q96L42 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
KCNH8Q96L42 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
KCNH8Q96L42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
KCNH8Q96L42 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
KCNH8Q96L42 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
KCNH8Q96L42 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
KCNH8Q96L42 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
KCNH8Q96L42 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
KCNH8Q96L42 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
KCNH8Q96L42 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
KCNH8Q96L42 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
KCNH8Q96L42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
KCNH8Q96L42 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
KCNH8Q96L42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
KCNH8Q96L42 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
KCNH8Q96L42 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
KCNH8Q96L42 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
KCNH8Q96L42 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms