Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPGRIP1Q96KN7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPGRIP1Q96KN7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPGRIP1Q96KN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPGRIP1Q96KN7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPGRIP1Q96KN7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPGRIP1Q96KN7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPGRIP1Q96KN7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RPGRIP1Q96KN7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPGRIP1Q96KN7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPGRIP1Q96KN7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPGRIP1Q96KN7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPGRIP1Q96KN7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPGRIP1Q96KN7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms