Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITCHQ96J02 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITCHQ96J02 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITCHQ96J02 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITCHQ96J02 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITCHQ96J02 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITCHQ96J02 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITCHQ96J02 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.2 ms