Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAX2Q96IS3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAX2Q96IS3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAX2Q96IS3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAX2Q96IS3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAX2Q96IS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAX2Q96IS3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAX2Q96IS3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAX2Q96IS3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAX2Q96IS3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAX2Q96IS3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms