Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPNQ96H22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPNQ96H22 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPNQ96H22 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CENPNQ96H22 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CENPNQ96H22 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPNQ96H22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPNQ96H22 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms