Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC46Q96FV0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC46Q96FV0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC46Q96FV0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC46Q96FV0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC46Q96FV0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms