Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE2Q96FN4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPNE2Q96FN4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPNE2Q96FN4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE2Q96FN4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE2Q96FN4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE2Q96FN4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms