Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3IP1Q96FE7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3IP1Q96FE7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3IP1Q96FE7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PIK3IP1Q96FE7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIK3IP1Q96FE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIK3IP1Q96FE7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms