Protein–RNA interactions for Protein: Q96FB5

RRNAD1, Protein RRNAD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRNAD1Q96FB5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RRNAD1Q96FB5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RRNAD1Q96FB5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RRNAD1Q96FB5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRNAD1Q96FB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RRNAD1Q96FB5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms