Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC97Q96F63 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC97Q96F63 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC97Q96F63 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC97Q96F63 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC97Q96F63 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms