Protein–RNA interactions for Protein: Q96EN9

C19orf60, Uncharacterized protein C19orf60, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf60Q96EN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C19orf60Q96EN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C19orf60Q96EN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C19orf60Q96EN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C19orf60Q96EN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C19orf60Q96EN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C19orf60Q96EN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms