Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3KBP1Q96B97 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3KBP1Q96B97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3KBP1Q96B97 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3KBP1Q96B97 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH3KBP1Q96B97 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3KBP1Q96B97 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3KBP1Q96B97 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms