Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX9

MIB2, E3 ubiquitin-protein ligase MIB2, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2Q96AX9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIB2Q96AX9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MIB2Q96AX9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIB2Q96AX9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MIB2Q96AX9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MIB2Q96AX9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MIB2Q96AX9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms