Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UTP4Q969X6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UTP4Q969X6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UTP4Q969X6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTP4Q969X6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTP4Q969X6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UTP4Q969X6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UTP4Q969X6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms