Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SNX21Q969T3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SNX21Q969T3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SNX21Q969T3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SNX21Q969T3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
SNX21Q969T3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SNX21Q969T3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SNX21Q969T3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX21Q969T3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SNX21Q969T3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SNX21Q969T3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SNX21Q969T3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SNX21Q969T3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms