Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFD1Q92890 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UFD1Q92890 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UFD1Q92890 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UFD1Q92890 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFD1Q92890 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFD1Q92890 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms