Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SEMA4DQ92854 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SEMA4DQ92854 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SEMA4DQ92854 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SEMA4DQ92854 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEMA4DQ92854 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SEMA4DQ92854 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms