Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP5

TNFAIP8L1, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L1Q8WVP5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFAIP8L1Q8WVP5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFAIP8L1Q8WVP5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFAIP8L1Q8WVP5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNFAIP8L1Q8WVP5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFAIP8L1Q8WVP5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms