Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSC4DQ8WTU2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSC4DQ8WTU2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSC4DQ8WTU2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSC4DQ8WTU2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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