Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP33Q8TEY7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
USP33Q8TEY7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP33Q8TEY7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP33Q8TEY7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP33Q8TEY7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP33Q8TEY7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP33Q8TEY7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP33Q8TEY7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP33Q8TEY7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP33Q8TEY7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP33Q8TEY7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP33Q8TEY7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms