Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
VANGL1Q8TAA9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VANGL1Q8TAA9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VANGL1Q8TAA9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VANGL1Q8TAA9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VANGL1Q8TAA9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VANGL1Q8TAA9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VANGL1Q8TAA9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VANGL1Q8TAA9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VANGL1Q8TAA9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms