Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NEDD1Q8NHV4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NEDD1Q8NHV4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEDD1Q8NHV4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NEDD1Q8NHV4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEDD1Q8NHV4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEDD1Q8NHV4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NEDD1Q8NHV4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEDD1Q8NHV4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NEDD1Q8NHV4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEDD1Q8NHV4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEDD1Q8NHV4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEDD1Q8NHV4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEDD1Q8NHV4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD1Q8NHV4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD1Q8NHV4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD1Q8NHV4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NEDD1Q8NHV4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEDD1Q8NHV4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NEDD1Q8NHV4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms