Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PJA1Q8NG27 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PJA1Q8NG27 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PJA1Q8NG27 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PJA1Q8NG27 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PJA1Q8NG27 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PJA1Q8NG27 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PJA1Q8NG27 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms