Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF548Q8NEK5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF548Q8NEK5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF548Q8NEK5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF548Q8NEK5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF548Q8NEK5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
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