Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPFIBP2Q8ND30 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPFIBP2Q8ND30 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPFIBP2Q8ND30 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPFIBP2Q8ND30 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP2Q8ND30 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP2Q8ND30 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms