Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC150Q8NCX0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC150Q8NCX0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC150Q8NCX0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC150Q8NCX0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC150Q8NCX0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC150Q8NCX0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC150Q8NCX0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC150Q8NCX0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC150Q8NCX0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC150Q8NCX0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC150Q8NCX0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC150Q8NCX0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC150Q8NCX0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC150Q8NCX0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC150Q8NCX0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC150Q8NCX0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC150Q8NCX0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC150Q8NCX0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms