Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7E2

ZNF645, E3 ubiquitin-protein ligase ZNF645, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF645Q8N7E2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF645Q8N7E2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF645Q8N7E2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF645Q8N7E2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF645Q8N7E2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF645Q8N7E2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF645Q8N7E2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF645Q8N7E2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF645Q8N7E2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF645Q8N7E2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF645Q8N7E2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF645Q8N7E2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF645Q8N7E2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF645Q8N7E2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF645Q8N7E2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF645Q8N7E2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF645Q8N7E2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF645Q8N7E2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms