Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM199Q8N511 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMEM199Q8N511 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM199Q8N511 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMEM199Q8N511 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM199Q8N511 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMEM199Q8N511 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TMEM199Q8N511 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMEM199Q8N511 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM199Q8N511 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM199Q8N511 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMEM199Q8N511 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMEM199Q8N511 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM199Q8N511 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMEM199Q8N511 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMEM199Q8N511 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM199Q8N511 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMEM199Q8N511 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM199Q8N511 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM199Q8N511 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM199Q8N511 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM199Q8N511 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM199Q8N511 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM199Q8N511 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM199Q8N511 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms