Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHCHD4Q8N4Q1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHCHD4Q8N4Q1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHCHD4Q8N4Q1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHCHD4Q8N4Q1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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