Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NINQ8N4C6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NINQ8N4C6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NINQ8N4C6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NINQ8N4C6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NINQ8N4C6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NINQ8N4C6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms