Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHACTR4Q8IZ21 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PHACTR4Q8IZ21 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHACTR4Q8IZ21 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHACTR4Q8IZ21 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHACTR4Q8IZ21 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHACTR4Q8IZ21 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHACTR4Q8IZ21 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHACTR4Q8IZ21 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHACTR4Q8IZ21 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHACTR4Q8IZ21 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHACTR4Q8IZ21 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms