Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC13Q8IYE1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC13Q8IYE1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC13Q8IYE1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC13Q8IYE1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC13Q8IYE1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC13Q8IYE1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms