Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC71Q8IV32 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC71Q8IV32 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC71Q8IV32 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC71Q8IV32 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC71Q8IV32 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC71Q8IV32 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms