Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUH8

SPPL2C, Signal peptide peptidase-like 2C, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2CQ8IUH8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPPL2CQ8IUH8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPPL2CQ8IUH8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL2CQ8IUH8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL2CQ8IUH8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPPL2CQ8IUH8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPPL2CQ8IUH8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms