Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX32Q86XE0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX32Q86XE0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX32Q86XE0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX32Q86XE0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX32Q86XE0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX32Q86XE0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNX32Q86XE0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX32Q86XE0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX32Q86XE0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX32Q86XE0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX32Q86XE0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX32Q86XE0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX32Q86XE0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms