Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RASSF3Q86WH2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RASSF3Q86WH2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RASSF3Q86WH2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RASSF3Q86WH2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RASSF3Q86WH2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RASSF3Q86WH2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RASSF3Q86WH2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms