Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TXNDC2Q86VQ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TXNDC2Q86VQ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
TXNDC2Q86VQ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TXNDC2Q86VQ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TXNDC2Q86VQ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TXNDC2Q86VQ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TXNDC2Q86VQ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TXNDC2Q86VQ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
TXNDC2Q86VQ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TXNDC2Q86VQ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TXNDC2Q86VQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TXNDC2Q86VQ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TXNDC2Q86VQ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TXNDC2Q86VQ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TXNDC2Q86VQ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TXNDC2Q86VQ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TXNDC2Q86VQ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
TXNDC2Q86VQ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TXNDC2Q86VQ3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
TXNDC2Q86VQ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
TXNDC2Q86VQ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TXNDC2Q86VQ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
TXNDC2Q86VQ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TXNDC2Q86VQ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
TXNDC2Q86VQ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
TXNDC2Q86VQ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
TXNDC2Q86VQ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TXNDC2Q86VQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TXNDC2Q86VQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TXNDC2Q86VQ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TXNDC2Q86VQ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms