Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z699

SPRED1, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1Q7Z699 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPRED1Q7Z699 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPRED1Q7Z699 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPRED1Q7Z699 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPRED1Q7Z699 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPRED1Q7Z699 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRED1Q7Z699 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPRED1Q7Z699 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPRED1Q7Z699 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SPRED1Q7Z699 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRED1Q7Z699 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPRED1Q7Z699 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms