Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAPPC11Q7Z392 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC11Q7Z392 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC11Q7Z392 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC11Q7Z392 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC11Q7Z392 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC11Q7Z392 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC11Q7Z392 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC11Q7Z392 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC11Q7Z392 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC11Q7Z392 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC11Q7Z392 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC11Q7Z392 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRAPPC11Q7Z392 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC11Q7Z392 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC11Q7Z392 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms