Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NLRP9Q7RTR0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP9Q7RTR0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLRP9Q7RTR0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP9Q7RTR0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NLRP9Q7RTR0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NLRP9Q7RTR0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms